东晋立国，通过金陵500年出一个天子的舆论，以显示其政权的正统性，以及人心所向，天命所归。玄学的妙用，被发挥得淋漓尽致。
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此后，南京的历史几乎就是之前历史的重演，始终处在金陵王气起—灭—起—灭的循环造势中。从孙权的吴国，到东晋，再经宋、齐、梁、陈四朝，均定都南京（当时分别称建业、建邺和建康）。南京成为妥妥的六朝古都。
侯景之乱后，公元552年，萧绎在江陵（今荆州）称帝，是为梁元帝。梁元帝一度想还都南京，群臣大多是荆州人，纷纷站出来说，金陵王气已尽，轮到荆州出天子了，陛下应该顺应天意，留在这里。仅仅3年后，西魏5万大军攻陷江陵，梁元帝被人用土袋闷死，江陵“阖城老幼被虏入关”。可见，“王气”这个东西，宣传造势可以，当真的话就真要出人命。
到了589年，隋朝51万大军兵临南京城下，南陈后主陈叔宝却说：“王气在此，齐兵三度来，周人再度至，无不摧没。今虏虽来，必应自败。”众所周知，金陵王气没能成为他的护身符。他在胭脂井中被俘，南朝寿终正寝。
在陈朝被灭之前，太府卿韦鼎把在南京的田地和房子都卖掉了，朋友不解，问他原因。韦鼎说：“江东王气，尽于此矣！吾与尔当葬长安。”南朝的灭亡，很长时间内是一个象征性事件，标志着金陵王气的终结。